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2023-06-07 06:46:02TONY杂谈600

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对于文献检索而言。一些辅助的工具,可以帮助我们更好的了解检索到的主要内容。之前我们介绍过一介绍过几个可以用来进行分析的工具。比如:connectedpapers、LitSense、PubTator。以上的这些工具各有各的用途。今天就来在给大家介绍一个基于pubmed来进行分析的工具吧。

1. Pubreminer

Pubreminer是一个基于pubmed检索结果来统计分析的工具。我们只需要输入pubmed的检索式。同时也可以进行个性化选择,比如检索年限的限制。

例如,我们这里在标题和摘要当中检索TCGA,同时想要查看一下2018年以后的文献都有哪些。

通过检索之后,就可以返回检索到这些文章的统计信息。这个工具主要能对发表年限、发表杂志、关键词、主题词、发表类型进行统计。

利用这个工具其实也是可以进行投稿杂志筛选的。通过这样检索。我们发现利用TCGA发表的文献都有哪些。

2. Search Workbench

Search Workbench[https://searchworkbench.info/]是一个检查、编辑和可视化PubMed搜索结果的工具。在这个工具当中,

我们可以通过输入关键词TCGA,首先可以看到的是检索到的相关结果每年的发表占比。

如果我们在输入多个检索结果,比如再输入miRNA。这样就可以比较miRNA的检索检索结果和TCGA的检索结果了。比较结果一方面可以在发表占比当中看到。同时也会有一个Venn图来进行展示的。

在venn图当中,可以看到,TCGA发表的文章当中,涉及到miRNA的其实只占了一小部分。

写在最后

以上就是我们对pubmed在线挖掘的工具。有兴趣的同学可以用一下哈。这类的工具,对于我们进行简单的文献数据挖掘还是很有帮助的。有需要的童鞋可以试一下的哈。

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